El órgano soberano del  Partido Popular de Alcalá de Henares son las Asambleas Locales, que se convoca, con carácter ordinario, cada tres años. También puede tener lugar de forma extraordinaria, de acuerdo a los Estatutos y Reglamento de Organización Regional.

En la última Asamblea Local, de abril de 2008, Bartolomé González volvió a ser reelegido Presidente por una mayoría abrumadora y una participación histórica.